Ограничения культуральных и микроскопических методов для выявления T.vaginalis заставили учёных развивать альтернативные методы, которые могут определять антиген, антитело или нуклеиновые кислоты в уретральном или вагинальном экссудате. Иммунологические методы не получили должного распространения из-за отсутствия качественных отечественных тест-систем. Кроме этого, все методы серологической диагностики T.vaginalis мало информативны, т. к данный антиген не вызывает 100%-го иммунного ответа. Хотя для подтверждения диагноза ими можно воспользоваться. Используются различные методы определения антител: агглютинация, непрямая гемаглютинация, диффузия в геле, флюоресценция антител и иммуноферментный анализ, метод иммуноблотинга. Определённое диагностичическое значение имеет прямое определение специфических белков T.vaginalis в биопробах с использованием моноклональных антител в качестве быстрого метода диагностики трихомоноза. Прямой иммуноферментный и иммунофлюоресцентный анализ мазков вагинального соскоба (тест-система фирмы California Integrated Diagnostics, Benicia, Calif.), использующий перокидазо - и флюорохром - меченые смеси моноклональных антител к различным структурам T.vaginalis был таким же чувствительным и специфичным, как и используемый культуральный метод. К тому же результаты определения возбудителя трихомоноза получают в течение одного часа, что позволяет произвести экспресс-скрининг [10,17,35,41,42].